2月1日，浙江省疾控中心上線了自動化的全基因組檢測分析平臺，該平臺利用阿里達(dá)摩院研發(fā)的AI算法，可將原來數(shù)小時的疑似病例基因分析縮短至半小時，大幅縮短確診時間，并能精準(zhǔn)檢測出病毒的變異情況。
當(dāng)前，快速、精確診斷對于疫情控制尤其重要。目前醫(yī)院普遍采用核酸檢測方法，只能檢測到病毒基因的局部。由于病毒存在變異的可能性，對于整個基因序列來說這種檢測方法猶如盲人摸象，一旦病毒發(fā)生變異，就可能出現(xiàn)漏檢的情況。
全基因組檢測分析平臺由浙江省疾病預(yù)防控制中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊和杰毅生物技術(shù)公司共同研發(fā)。該平臺采用不同于核酸檢測方法的全基因組檢測技術(shù)，對疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列分析比對，能夠有效防止病毒變異產(chǎn)生的漏檢，并將原需數(shù)小時的全基因分析流程減少到半小時，大幅提高疑似病例的確診速度和準(zhǔn)確率。
據(jù)悉，疫情發(fā)生后，阿里達(dá)摩院算法專家顧斐立即奔赴浙江省疾控中心，針對新型冠狀病毒基因進(jìn)行特征分析，并推出多個算法模型。在序列比對過程中，達(dá)摩院對算法增加了分布式設(shè)計，有效提升比對效率;在病毒序列拼接階段使用分布式設(shè)計的de Bruijn圖算法，變異病毒也能精準(zhǔn)檢測。
浙江省疾控中心基因測序負(fù)責(zé)人孫逸表示：“該平臺基于阿里云的算力與達(dá)摩院新算法可以為病毒的解析提供支撐，基于該平臺，未來還可以在短時間內(nèi)將檢測范圍覆蓋整個確診病例，也為后續(xù)疫苗與藥物研發(fā)打下了基礎(chǔ)。”(記者魏蔚)
